Die Specialized Master-Studiengänge (Mastères Spécialisés®) der ENGEES ermöglichen innerhalb eines Jahres den Erwerb eines umfangreichen technischen Spezialwissens im Bereich Wasser- und Abfallwirtschaft, das derzeit sehr stark nachgefragt wird. Sowohl die nachhaltige Entwicklung als auch der Umweltschutz sind wichtige Bausteine dieser weiterführenden Studiengänge. Die Specialized Master® stehen Absolventen eines fünfjährigen Hochschulstudiums (Masterabschluss) sowie Praktikern mit Bac +4 (Abitur + 4 Jahre Studium) und mindestens drei Jahren Berufserfahrung offen.

Die Specialized Masters® der ENGEES werden von der Conférence des Grandes Ecoles (CGE) akkreditiert.
Die Abteiliung für berufliche Weiterbildung (Direction de la formation professionnelle) der ENGEES, die dieses Studium managt, ist nach ISO 9001 zertifiziert.